Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I4

Stx17, Syntaxin-17, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx17Q9D0I4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stx17Q9D0I4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Stx17Q9D0I4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Stx17Q9D0I4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Stx17Q9D0I4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms