Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndc80Q9D0F1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndc80Q9D0F1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndc80Q9D0F1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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