Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ccdc47Q9D024 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ccdc47Q9D024 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ccdc47Q9D024 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ccdc47Q9D024 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccdc47Q9D024 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
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