Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Prelid3bQ9CYY7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Prelid3bQ9CYY7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prelid3bQ9CYY7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Prelid3bQ9CYY7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Prelid3bQ9CYY7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms