Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYR0

Ssbp1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp1Q9CYR0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ssbp1Q9CYR0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ssbp1Q9CYR0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ssbp1Q9CYR0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ssbp1Q9CYR0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms