Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9CYI0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9CYI0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9CYI0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9CYI0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9CYI0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9CYI0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9CYI0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q9CYI0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Q9CYI0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9CYI0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9CYI0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9CYI0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q9CYI0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9CYI0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9CYI0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q9CYI0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q9CYI0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Q9CYI0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms