Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmem39aQ9CYC3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tmem39aQ9CYC3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tmem39aQ9CYC3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tmem39aQ9CYC3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tmem39aQ9CYC3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms