Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXW4

Rpl11, 60S ribosomal protein L11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl11Q9CXW4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rpl11Q9CXW4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rpl11Q9CXW4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rpl11Q9CXW4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms