Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PmpcbQ9CXT8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PmpcbQ9CXT8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PmpcbQ9CXT8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms