Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXF7

Chd1l, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1lQ9CXF7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,01■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25,01■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24,97■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24,96■■□□□ 1,59
Chd1lQ9CXF7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24,94■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,91■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24,9■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24,89■■□□□ 1,58
Chd1lQ9CXF7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,88■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24,87■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24,85■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24,83■■□□□ 1,57
Chd1lQ9CXF7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,82■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,8■■□□□ 1,56
Chd1lQ9CXF7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19,6 ms