Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWZ3

Rbm8a, RNA-binding protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm8aQ9CWZ3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbm8aQ9CWZ3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rbm8aQ9CWZ3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rbm8aQ9CWZ3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rbm8aQ9CWZ3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Rbm8aQ9CWZ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rbm8aQ9CWZ3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Rbm8aQ9CWZ3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms