Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Malsu1Q9CWV0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Malsu1Q9CWV0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Malsu1Q9CWV0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms