Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cnot11Q9CWN7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Cnot11Q9CWN7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cnot11Q9CWN7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cnot11Q9CWN7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
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