Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lhfpl3Q9CTN8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lhfpl3Q9CTN8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Lhfpl3Q9CTN8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Lhfpl3Q9CTN8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.8 ms