Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN5

Six6os1, Protein SIX6OS1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6os1Q9CTN5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Six6os1Q9CTN5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Six6os1Q9CTN5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Six6os1Q9CTN5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Six6os1Q9CTN5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Six6os1Q9CTN5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Six6os1Q9CTN5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Six6os1Q9CTN5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms