Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC9

Gnpda2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda2Q9CRC9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnpda2Q9CRC9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnpda2Q9CRC9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnpda2Q9CRC9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnpda2Q9CRC9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gnpda2Q9CRC9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnpda2Q9CRC9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnpda2Q9CRC9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnpda2Q9CRC9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnpda2Q9CRC9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnpda2Q9CRC9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnpda2Q9CRC9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gnpda2Q9CRC9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gnpda2Q9CRC9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gnpda2Q9CRC9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gnpda2Q9CRC9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gnpda2Q9CRC9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gnpda2Q9CRC9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gnpda2Q9CRC9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms