Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
4931417E11RikQ9CR05 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
4931417E11RikQ9CR05 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4931417E11RikQ9CR05 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms