Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Higd2aQ9CQJ1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Higd2aQ9CQJ1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Higd2aQ9CQJ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms