Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Q9CQF4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQF4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CQF4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Q9CQF4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQF4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQF4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQF4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Q9CQF4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQF4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQF4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQF4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Q9CQF4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CQF4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q9CQF4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.8 ms