Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab5aQ9CQD1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab5aQ9CQD1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rab5aQ9CQD1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms