Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rpa3Q9CQ71 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rpa3Q9CQ71 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rpa3Q9CQ71 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rpa3Q9CQ71 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms