Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

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Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl49Q9CQ40 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Mrpl49Q9CQ40 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Mrpl49Q9CQ40 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Mrpl49Q9CQ40 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Mrpl49Q9CQ40 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl49Q9CQ40 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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Mrpl49Q9CQ40 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Mrpl49Q9CQ40 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Mrpl49Q9CQ40 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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Mrpl49Q9CQ40 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl49Q9CQ40 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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