Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trim26Q99PN3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trim26Q99PN3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Trim26Q99PN3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Trim26Q99PN3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Trim26Q99PN3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms