Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cep41Q99NF3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cep41Q99NF3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cep41Q99NF3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms