Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mrpl43Q99N89 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mrpl43Q99N89 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mrpl43Q99N89 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mrpl43Q99N89 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms