Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Brms1Q99N20 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Brms1Q99N20 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Brms1Q99N20 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brms1Q99N20 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms