Protein–RNA interactions for Protein: Q99MQ5

Col25a1, Collagen alpha-1(XXV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col25a1Q99MQ5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Col25a1Q99MQ5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col25a1Q99MQ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col25a1Q99MQ5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Col25a1Q99MQ5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.4 ms