Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KarsQ99MN1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
KarsQ99MN1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KarsQ99MN1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KarsQ99MN1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
KarsQ99MN1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms