Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ6

Pdzd3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd3Q99MJ6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdzd3Q99MJ6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd3Q99MJ6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd3Q99MJ6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd3Q99MJ6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pdzd3Q99MJ6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdzd3Q99MJ6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pdzd3Q99MJ6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdzd3Q99MJ6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdzd3Q99MJ6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms