Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ0

Cttnbp2nl, CTTNBP2 N-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cttnbp2nlQ99LJ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cttnbp2nlQ99LJ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms