Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,44■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,44■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21,43■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,43■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21,42■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,42■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21,41■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,41■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,4■■□□□ 1,02
Rab28Q99KL7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21,39■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21,39■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21,39■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,38■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21,38■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,38■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21,37■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21,36■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,36■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21,35■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21,34■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,34■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21,34■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,33■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21,33■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21,33■■□□□ 1,01
Rab28Q99KL7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,33■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,32■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21,31■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21,3■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21,3■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,3■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,29■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21,28■■□□□ 1
Rab28Q99KL7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21,28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58,5 ms