Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pls3Q99K51 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Pls3Q99K51 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pls3Q99K51 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pls3Q99K51 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pls3Q99K51 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms