Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nlgn1Q99K10 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nlgn1Q99K10 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Nlgn1Q99K10 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Nlgn1Q99K10 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Nlgn1Q99K10 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nlgn1Q99K10 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nlgn1Q99K10 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nlgn1Q99K10 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nlgn1Q99K10 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nlgn1Q99K10 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nlgn1Q99K10 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nlgn1Q99K10 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nlgn1Q99K10 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Nlgn1Q99K10 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Nlgn1Q99K10 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Nlgn1Q99K10 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Nlgn1Q99K10 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139 ms