Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarcd2Q99JR8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Smarcd2Q99JR8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smarcd2Q99JR8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smarcd2Q99JR8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms