Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Smim11aQ99J19 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Smim11aQ99J19 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smim11aQ99J19 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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