Protein–RNA interactions for Protein: Q99246

Cacna1d, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, mousemouse

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1dQ99246 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cacna1dQ99246 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cacna1dQ99246 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cacna1dQ99246 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms