Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cldn16Q925N4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cldn16Q925N4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cldn16Q925N4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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