Protein–RNA interactions for Protein: Q923Z4

Ferd3l, Fer3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ferd3lQ923Z4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ferd3lQ923Z4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ferd3lQ923Z4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ferd3lQ923Z4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms