Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sirt1Q923E4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sirt1Q923E4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sirt1Q923E4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Sirt1Q923E4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sirt1Q923E4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Sirt1Q923E4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sirt1Q923E4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sirt1Q923E4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Sirt1Q923E4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
Sirt1Q923E4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
Sirt1Q923E4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Sirt1Q923E4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Sirt1Q923E4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
Sirt1Q923E4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Sirt1Q923E4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms