Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Smarca5Q91ZW3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Smarca5Q91ZW3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Smarca5Q91ZW3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Smarca5Q91ZW3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms