Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ5

Rpe65, Retinoid isomerohydrolase, mousemouse

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpe65Q91ZQ5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpe65Q91ZQ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpe65Q91ZQ5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rpe65Q91ZQ5 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpe65Q91ZQ5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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