Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Prpf6Q91YR7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf6Q91YR7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prpf6Q91YR7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Prpf6Q91YR7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prpf6Q91YR7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms