Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y11

Pcdha9, Protocadherin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha9Q91Y11 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pcdha9Q91Y11 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha9Q91Y11 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha9Q91Y11 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha9Q91Y11 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms