Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tmco4Q91WU4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tmco4Q91WU4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tmco4Q91WU4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tmco4Q91WU4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.2 ms