Protein–RNA interactions for Protein: Q91VW9

Zkscan3, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan3Q91VW9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Zkscan3Q91VW9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zkscan3Q91VW9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zkscan3Q91VW9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Zkscan3Q91VW9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms