Protein–RNA interactions for Protein: Q91VH2

Snx9, Sorting nexin-9, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx9Q91VH2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Snx9Q91VH2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx9Q91VH2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx9Q91VH2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx9Q91VH2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms