Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Capn8Q91VA3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Capn8Q91VA3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Capn8Q91VA3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn8Q91VA3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Capn8Q91VA3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms