Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ApofQ91V80 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ApofQ91V80 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ApofQ91V80 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ApofQ91V80 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms