Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fyco1Q8VDC1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Fyco1Q8VDC1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Fyco1Q8VDC1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Fyco1Q8VDC1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Fyco1Q8VDC1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Fyco1Q8VDC1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms