Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sgip1Q8VD37 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sgip1Q8VD37 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sgip1Q8VD37 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sgip1Q8VD37 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sgip1Q8VD37 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sgip1Q8VD37 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sgip1Q8VD37 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sgip1Q8VD37 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sgip1Q8VD37 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98 ms